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AI设计是特定类型的细胞的“基因开关”

2025-05-11 09:53


《科学技术日报》(记者张曼甘兰)细胞杂志于5月8日发布了一项新研究:西班牙基因组中心团队使用生成人工智能(AI)来设计一个可以遵循的合成DNA,以遵循“基因开关”来控制特定的哺乳动物细胞。这种发展是合成生物学领域的一个里程碑。该技术可以根据特定需求“创建”自然界中不存在的DNA片段。该团队训练了AI模型,以预测适当的DNA字母组合(A,T,C,G),以实现特定细胞类型中的基因表达模式。例如,干细胞可以允许食用一个基因,该基因可以在红细胞而不是血小板中发展。然后,罪魁祸首sobone合成了大约250个字母的DNA片段,并通过病毒载体将其引入细胞。为了验证其有效性,团队要求AI设计对荧光蛋白基因的DNA依从性,然后将其插入小鼠的随机位置细胞基因组。结果表明,基因的表达与期望完全一致,证明了AI设计的合成增强剂的功能是正常的。在生物医学科学领域,许多疾病来自特定细胞中异常基因的表达,而传统方法只能依靠自然界中现有的DNA调节元件,例如增强子进行干预。但是,这些类型的增强剂是有限的,难以满足复杂的治疗用途。在AI中,科学家可以创建“基因开关”。这些人工增强剂可以精确设计为仅在特定细胞中起作用的“开/关”模式,从而显着降低了对健康细胞的影响。这种准确的调节对于开发新一代基因疗法至关重要。但是,训练这样的AI模型并不容易,与增强器相关的高质量数据总是很少。结果,团队对最近五年来开发最大的血细胞合成增强剂数据库。他们已经测试了38个不同转录因子的位点和强度,并监测了血细胞发育七个阶段的每个增强剂活性的变化。还发现了PAG - aaral一些有趣的现象:尽管大多数增强子都调节基因活性,例如“旋钮量”,但某些组合也显示出“负协同作用” - 也就是说,这是两个最初仅促进基因表达的因素,这些因素仅促进基因表达,这在它们出现时预防了基因活性。这种非线性关系为理解基因调节提供了一种新的观点。这一成功为未来的个性化医疗和准确的基因疗法打开了新的门。

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